在人类细胞中，DNA充满了组蛋白、RNA和染色质相关蛋白，形成粘性凝胶。在任何给定时刻，只有蛋白质组的一个子集可以结合DNA并组织其结构、转录、复制、修复和其他基本分子功能。2025年5月22日，德国弗赖辛慕尼黑工业大学（TUM）生命科学学院Bernhard Kuster团队在Cell（IF 45.5）杂志上发表了题为“The human proteome with direct physical access to DNA”的研究文章，开发了一种“零距离”光交联方法来定量与活细胞中DNA直接接触的蛋白质，这为探索基因组调控开辟了一条直接途径，适用于许多生物体和系统。

论述最终结果

1、从光敏培育细胞系中分离出DNA热塑营养物质质

是为了溶合光化学交连营养素质-DNA包覆物采用LC-MS分享，我们研发好几个种转化纯化细则，可从DNA中去要不是化学交连营养素质，仅在射进来的角时能够 随时表观遗传组触及丰度DNA化学交连营养素质。用TRIZOL洗去染色剂质并洗去逮捕获的非化学交连营养素，而后将其如何容解以实现RNase助消化不良。能够 超声心动图削切所得到营养素质化学交连DNA的洗去物，在硫氰酸胍中加热转化，并在二氧化的硅抽滤柱上心跳加快洗條以去要不是化学交连营养素质直结束。能够 核酸酶处置从DNA中解放光化学交连营养素，并实现胰营养素酶助消化不良采用LC-MS分享。该的方法被命名为营养素质化学交连DNA洗去或XDNAX。

图1.球蛋白交连DNA添加或XDNAX环节图（图源：Trendel, et al., Cell 2025）

2、可同时触碰DNA的淀粉酶质图谱

将光热塑策略应用软件于MCF7血血细胞，遇到了1,805种侯选球蛋清酶，至少1,191种长期存在于3个或比较多次多个中。60%的DNA充分影响组有带核酸依照的GO参考文献标注，在由于缺乏核酸依照参考文献标注的球蛋清酶质中，极限的奉献发源核纤层球蛋清酶，二是参与进来染色剂质团体和血血细胞分裂主义的球蛋清酶质（图2）。

图2 . 可会直接接触到 DNA 的核膳食纤维（改自：Trendel, et al., Cell 2025）

图3归纳了DNA共同效用组所潜在的淀粉酶质-DNA画质试述包涵的核苷酸化学交联肽。这包含鉴于（1）球状DNA整合实际型式域、（2）DNA 整合实际混乱区（IDR）和（3）鉴于与许多淀粉酶质（举例说明组淀粉酶整合实际淀粉酶）、RNA（举例说明剪接系数）或相提取区室（举例说明核仁淀粉酶）共同效用而形成的环镜将近。

图3 . 可会接触到 DNA的组成域（改自：Trendel, et al., Cell 2025）

3、酶联免疫法组织细胞扰动这段时间内与DNA综合的转录指数公式

雌性生长生长激素感觉α（ESR1）驻留下来胞质溶胶中，一直到会遇到其配体，启用易位到体细胞膜膜，在绿中岛别墅它与遗传基因组中的某一区域环境紧密联系以促活某一的转录过程。将血清饥饿的MCF7体细胞膜膜表露于高药量雌性生长生长激素（10 nM 17β-雌二醇）44分种，与摸拟除理的对比体细胞膜膜相对同旁内角的DNA彼此做用组（图4A）。其中的，雌性生长生长激素敏感后DNA彼此做用组中的ESR1加大了30倍（图4B）。总的说，在1,814个定量分析的营养物质质-DNA彼此做用中，约有9%体现出突破2倍的有效的变化，并通过观察到与ESR1具备彼此做用的营养物质如POLR2A和SMARCA4等（图4B-C）。

图4 雌荷尔蒙正确处理乳腺炎肿瘤细胞系 DNA 互为功效组的一定量更（图源：Trendel, et al., Cell 2025）

总结ppt

钻研进到基因遗传组组的核膳食纤维以详细了解它是怎么样去 被写入并付诸实训的，时不时是成果转化师是一个长期性的的喜欢。基因遗传组组可及性最主要以DNA为心中的立场开始钻研，以至于，到现如今结束，染料质疑胶中的哪方面核膳食纤维与DNA 突发高中物理主动间效应尚不弄清楚。使用的零相应光热塑，可表明DNA主动间效应组中的基本都数核膳食纤维，XDNAX能力将有所作为核膳食纤维-DNA主动间效应钻研的强悍交通工具。

拜谱工作小结

该研究基于LC-MS/MS蛋白质谱开发的XDNAX技术，实现了活细胞内蛋白质与DNA直接相互作用的精准捕获与定量分析，绘制了高分辨率的人类DNA互作蛋白图谱，为解析基因组调控网络提供了全新工具。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司，可提供完善成熟的球营养物质组学、装饰组学、代谢率组学、转录组学等多组学产品技术服务体系，整合多组学数据进行深入挖掘分析，全面解析机制机理等，助力高分文章发表。欢迎咨询！

学习文献综述：

Trendel J, Trendel S, Sha S, Greulich F, Goll S, Wudy SI, Kleigrewe K, Kubicek S, Uhlenhaut NH, Kuster B. The human proteome with direct physical access to DNA. Cell. 2025 May 14:S0092-8674(25)00507-0. doi: 10.1016/j.cell.2025.04.037.