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项目文章(Cancer Letters IF:10.1)|从糖代谢到表观遗传:肝癌进展的隐藏引擎

发布时间:2025-11-21
分泌重源程序是恶性肺部肿癌会发生和进步的圆形标志,夏黑葡萄糖注射液分泌的提升起着本质功用。这转换使恶性肺部肿癌人体癌细胞才能最快得电能并形成必不可少的分泌上面体,以此鼓励加强繁殖。虽说兼具重点重大意义,但恶性肺部肿癌人体癌细胞调整糖酵解的机制化仍不认识。

近日,沈阳医科一本大学首要附带专科医院王学浩科学院院士拜谱生物在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,血清互作组和靶向治疗人体脂肪代谢转化检测分析服务。

国外英文问题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)

中文翻译宝贝标题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路

老客户企业单位:南京医科大学

钻研用料:细胞

拜谱提拱工作:转录组测序+蛋白酶互作组+靶向药物能量场分泌组

技术设备路线地图:

探索成果

01、YBX1被司法鉴定为HCC中糖酵解的重要性人类基因

本研究解析搜集HCC肺部肉瘤模本(n=7)的单公司结构恶性癌症体细胞RNA测序数值文件集来解析,看到糖酵解亲水性大部分密集在肺部肉瘤公司结构恶性癌症体细胞中,hdWGCNA解析识別出9个表观遗传包块(图1A-G)。TCGA-LIHC列队的经营解析判断YBX1为自由经营风险隐患条件(图1H)。进1步融入IHC、WB实验所和肺部肉瘤公司结构与挨近非肺部肉瘤公司结构的范围转录组学数值文件集灵魂存在YBX1是肝公司结构恶性癌症体细胞癌医疗的内在靶点(图1I-K)。

图1:YBX1被明确为调试HCC细胞核糖酵解的最为关键的客观因素

02、YBX1带动HCC中的有氧糖酵解和增值

为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向药物动能基础代谢组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。

图2:YBX1有利于HCC中的有氧糖酵解和增值能力

03、OGT与YBX1搭配并促使YBX1的O-GlcNAc糖基化

为了识别YBX1的调控因子,球蛋白互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。

图3:OGT与YBX1切合并有助于YBX1的O-GlcNAc糖基化

04、YBX1的O-GlcNAc糖基化可以淡化其磷硝化作用,最后可以淡化其核转位

进一点判断YBX1的O-GlcNAc糖基化是否有干扰其磷碱化,在OGT敲低的HCC神经元中或用OGT缓和剂OSMI-1操作,YBX1淀粉酶横向特殊降,YBX1磷碱化特殊降低(图4A-C)。IP进行实验彰显,在重复的Flag-YBX1底物横向下,YBX1-WT的磷碱化横向特殊高出YBX1-T57A,反映出磷碱化的增长不单单仅是如果更多的YBX1淀粉酶把你想表达出来爱(图4D)。分离处里了核和质多组分知道TMG操作的HCC神经元中YBX1核把你想表达出来爱的身高(图4E-F),进一点知道YBX1磷碱化的关键因素调高因素是AKT(图4G-I)。这部分知道突出O-GlcNAc糖基化顺利通过驱动其磷碱化来带动YBX1淀粉酶稳定可靠性并驱动核转位。

图 4.YBX1的 O-GlcNAc 体现极为有有助其进一歩形成磷硝化作用体现并要提高网站其核转位

05、YBX1推动PKM2转录

前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。

图 5.YBX1加速PKM2转录

06、YBX1 能的提升组蛋白酶乳酸性反应绘制水准

探索表明YBX1敲低差异性大大减少血清质乳碱化,特别的是H3K18乳碱化(图6A-C)。糖酵解缓和剂2-DG的进行实验得知了糖酵解与组血清乳碱化的马上同步,缓和糖酵解可差异性大大减少H3K18la总体水平(图6D)。PKM2过呈现不可逆转转YBX1敲低导致的的H3K18la的降低,之外源乳酸净化处理不单上升H3K18la,还引发YBX1呈现调整,显示系统会有正面回馈(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR得知,H3K18la确认聚集于YBX1开机子马上有助于其转录,该时受O-GlcNAc糖基化调节作用(图6H-J),并表明P300 调整是YBX1提高H3K18乳酰凝成用的管理机制(图6K-L)。

图6.YBX1激发H3K18乳硝化作用修饰语品质

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在一项探索中媒体报道了YBX1在HCC中高表达出方式,且与糖酵解析切相应的。YBX1在T57处被O-GlcNAc突显,最终得以平衡氨基酸质并加大其表达出方式。这样的突显还促使YBX1在T57处的磷碱化,促使其核易位。故而,上述操作过程明显增强了糖酵解相应的DNA组的转录并条件刺激乳酸的导致。除外,YBX1激活码P300的转录,行而推动组氨基酸的乳碱化,比较是H3K18la,H3K18乳碱化顺向自我调节YBX1DNA组转录(图7)。

图7.Y糖酵解-表观基因遗传双面馈环制度化图

拜谱个人总结

本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱微生物为该研究提供了转录组测序,核蛋白互作组和靶向治疗能量消耗基础代谢组技术服务,拜谱微生物建立了完善成熟的转录组学、蛋白质组学、全文翻译后掩盖组学、代谢转化组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!

分类论文

Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.
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