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首页 > 拜谱生物 > 干货分享 > 网络上药理学学阐述草酸钙肾结石硫化应激性和炎症病变断裂工作机制

网络药理学揭示草酸钙肾结石氧化应激和炎症损伤机制

发布时间:2024-08-02
草酸钙(CaOx)肾结石是泌尿设计常用见的肠腔疾病中的一种。肾团体中CaOx多晶体过过剩火成岩会发生肾小管细胞系破损和凋亡,所以发生肾结石的形成了。短链人体皮下脂肪酸由肠腔内活性污泥菌类食物发酵膳食结构弹性纤维发生,这不仅在布局肠腔防御系统软件中起到影响,可是在设计质量上也起到重要影响。其中的,丁酸是最多样化的短链人体皮下脂肪酸,兼有消除炎症和免役抑定制用影响,本调查初探丁酸对CaOx肾结石的影响下列不属于潜在性靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究,华山卫生院泌尿急诊科吴忠院士、周子健院士于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果,7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠博士生生导师、周子健博士生在Food and Chemical Toxicology(IF=4.3)上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤,并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因,最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱微生物与吴忠教授、周子健博士团队再次合作,提供了线上药学学精准服务,助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点,为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

篇文章名字大全:Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9(Food Chem Toxicol.,IF=4.3,2023.07) 消费者政府部门:华山门诊 钻研群体:大鼠、HK-2细胞系 排序产品信息:比组(Con)、沙盘模型组(Model)和丁酸钠组(NaB) 拜谱展示技艺:在线临床药理学查测

要点工作流程表

科研但是

设计人数第一步建设大鼠建模,利用生理变化生物化指数公式和组织化方面的问题学印染等设计方式方法会发现丁酸可能缩减CaOx建模大鼠肾CaOx纳米线的转变成和挫裂伤,解决CaOx建模大鼠的真菌感染挫裂伤和阳极脱色有害物质的过渡理解。虽然,丁酸还可治理和改善草酸诱发的HK-2血受损细胞挫裂伤、阳极脱色应激性和血受损细胞凋亡。 为实验设计丁酸框架和靶dna线上,深入深入数据了解工作人员从PubChem获取一个丁酸和丁酸酯的二维和三维空间框架(图1A)。依据PharmMapper统计的数据源表和Uniprot统计的数据源表解决后共筛分出11八个丁酸靶dna供进那步深入数据了解。将dna汇总接入STRING统计的数据源表,实现PPI线上深入数据了解。Cytoscape明确了去重复的前20的核心区靶dna的详解线上图,具有CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2(图1B)。这类核心区dna与线上中的另一dna均表现形式出一些的相应性,发现这类dna几率表现着协同作战影响。GO和KEGG深入数据了解体现了了丁酸核心区dna的相应行业和动物学实用功能(图1C)。核心区dna包括与类固醇生长荷尔蒙回应、硫化应激的反应性回应、有机化学活化氧细胞系对类固醇生长荷尔蒙多种多样的不起用处并且 对偏酸有机化学材质的不起用处管于。经验经验,这类核心区dna包括操作了硫化应激的反应性和对有机化学活化氧的动物不起用处时,是肾结石行成制度化中至关必要的行业,这发现丁酸几率在肾结石中表现必要影响。

图1| 丁酸成分与靶基因遗传网站定性分析(图源:Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进一大步探险丁酸对CaOx肾结石真的切靶染色体,论述者实现GEO统计资料文件库对GSE73680中健康生活较与CaOx肾结石病人的染色体不同之处去了论述。较组与CaOx结石病人的取得性不同之处传达染色体(DEGs)选择标准单位为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共选择到3783个染色体遭受取得改变,当中3379个(89.4%)染色体传达调整,404个(10.6%)染色体传达下跌(图2A)。对DEGs去聚类分析法浅析浅析,热图表明了前10个被选中DEGs的二维分类聚类分析法浅析优点(图2B)。其次,论述者实现GeneCards统计资料文件库机器认定了370个应该与CaOx肾结石涉及到的的染色体,排行榜前20位的预侧染色体下列关于涉及到的性评定如图甲已知2C已知。因为找寻丁酸制疗CaOx肾结石的关键点靶点,论述者将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石涉及到的染色体治理 实现好几回个Venn图。终结,CYP2C9被断定为丁酸直接影响CaOx肾结石的隐藏的靶点(图2D)。不但,论述者还去了丁酸与CYP2C9的原子核连通,CYP2C9的三种氨基残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸主动用处,氢键能为4.2 kcal/mol(图2E)。 在运用网络上药理学学精准预测CYP2C9是丁酸危害CaOx肾结石的靶基因组后,设计者还依据血神经元测试印证了CYP2C9可降低草酸分析的HK-2血神经元的ROS总体水平、炎症病变伤到和凋亡。

图2| 越多越据库协同介绍預測CYP2C9是丁酸的作用于CaOx肾结石的靶什么是基因

的研究结果显示

本研究分析先要知道丁酸在离体和身体内部均能抑止CaOx肾结石实体模型的脱色应激状态状态和感染挤压伤,接着完成数据系统药学学筛分赢得丁酸影响力CaOx肾结石的意向靶点——CYP2C9,最好完成人体人体细胞实验英文验证CYP2C9在草酸盐引发的HK-2人体人体细胞ROS平行、感染挤压伤和凋亡。以下知道表示丁酸应该完成抑止CYP2C9来抑止CaOx肾结石的脱色应激状态状态,调低感染挤压伤。这全过程中拜谱海洋生物体带来了数据系统药学学新技木咨询了解。于,还有就是拜谱海洋生物体可上升成孰全面的DNA组学、淀粉酶质组学、细胞代谢组学等几组学好产品及新技木咨询了解。于,喜欢详询咨询了解。! 参考选取期刊论文:Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.
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