
拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康酸性反应掩盖蛋白质组学产品,实现1000+什么难以理解的度突显位点排除,维持再次出现精典靶点,全地方生信分享解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“发现了”到“确认”全注意事项服务保障,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。
PART 1
01、调查流程图
02、测量信息
03、经“点”逆转
在测量数剧中,检测出二个参考文献中简讯的典型靶点简述衣康酸体现语位点,如第1个被知道的衣康酸共价体现语球淀粉酶KEAP1,还有糖酵解环路中的3个关键点因素酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,还有炎性小体包含球淀粉酶NLRP3和体细胞挫裂阶段中的关键点因素球淀粉酶RIPK3等,其质谱图方式图如图是。
04、食品基本特征
1.强有力的加密管控质控
工业化特女性朋友探头孵育、SDS-PAGE检查测量工具、WB印证、样例一些性解析等各方向检查测量工具,确保安全生产活动结杲准确性。2.高特点质谱机器设备平台网站
在Orbitrap Astral全新一批高辨别好坏质谱仪六道金刚咒下,保证衣康酸性反应表达位点及血清检验新厚度,帮助科学实验探索新看见。3.全流程图一坐式工作
特征提取拜谱动物成熟的实践APP,可提拱“组织训练→电极孵育→WB检验→艰深度衣康酸性反应绘制检验→炫舞心悦生信剖析→目标位点PRM手机验证”全标准流程服务管理,省时杠杆原理更贴心。05、分析一下主要内容(局部)
06、应该用定位
PART 2、参考文献分享一下
文献综述一
英语怎么说题目:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)
中文翻译题目:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析
分析知识:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。
(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)
论文参考文献二
因为宝贝标题:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)
简体中文大标题:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性
理论研究项目:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。
(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)
PART 3、案列衍生产品构思
蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13都具有弱于的底物依照力,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。
S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。
(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)
值得一提的是,在拜谱生物制品衣康过酸体现组测评数据表格中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康酸性反应遮盖(下面的图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。
PART 4、拜谱个人总结
作为一个TCA不断循环中的其中分解转化物,衣康酸转换分解转化、抗体力系统和慢性支原体感染当中的相互之间效用,为医疗抗体力系统慢性支原体感染性病毒给出了充当医疗战略。衣康酸架构中的亲电性α,β-不饱和羧酸架构能对血清质上的活力半胱氨酸残基参与烷基化体现(迈克尔减伤反馈),相应英译后体现被分为“衣康酸体现(itaconation)”,从而关系血清质功效,控制抗体力系统回话和分解转化条件,为几种病毒中成药科研给出新想法。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康硝化作用修饰语球蛋白组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物分子生物学可以说参考值靶向药物分解组(QMT1000)或能力消化吸收靶向药物消化吸收组软件对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!
考虑论文
1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.